La plateforme HYPERION (HYPE Research in Immunology and ONcology) est née en 2019 avec l’acquisition du cytomètre de masse imageur.
Elle se situe dans les locaux du laboratoire Lymphocytes B, Autoimmunité et Immunothérapies UMR1227, au sein de l’hôpital Morvan de Brest et propose un ensemble de prestations centrées sur la cytométrie en flux, le tri cellulaire, la cytométrie de masse ou l'imagerie multiplexée (masse ou fluorescence)
Le personnel de la plateforme possède des compétences scientifiques et techniques pour les projets étudiant tous types de cellules ou de tissus. La plateforme est ouverte à toute la communauté scientifique du public ou de privé.
Les technologies
La cytométrie en flux est une technique rapide et précise de caractérisation individuelle de particules isolées en suspension, entrainées par un flux liquide (sheath) jusqu'à une source d'excitation lumineuse (laser). Elle permet également le tri cellulaire à haute vitesse, qui consiste en une séparation physique de différentes sous-populations à partir d'un échantillon hétérogène.
La cytométrie spectrale, tout comme la cytométrie conventionnelle, permet de qualifier et quantifier les molécules révélées par un anticorps couplé à un fluorochrome. La différence réside dans la collecte du signal sur 64 détecteurs consécutifs permettant de créer une signature spectrale par fluorochrome. C'est ainsi qu'avec notre Aurora (CYTEK) munis de 5 lasers, il est possible de réaliser un panel 40 couleurs (OMIP-069).
La cytométrie de masse CyTOF utilise des métaux rares conjugués à des anticorps pour analyser près de 50 marqueurs différents extra on intra-cellulaire. Cette technologie est destructive mais permet de s'affranchir de l'autofluorescence cellulaire ainsi que de la nécessité de compenser/unmixer.
La cytométrie de masse en image réalisée par l’Hypérion s’effectue sur des coupes de tissus toujours à l’aide d’anticorps couplés à des métaux. Là encore, elle permet de s'affranchir de l'autofluorescence ce qui en fait une technique de choix sur tous les tissus très autofluorescents (peau, poumon ...). Elle a révolutionné l'analyse d'image multiplexée en permettant la détection simultanée de plus de 40 marqueurs.
L'imagerie multiplexée en fluorescence fait partie des dernières acquisitions de la plateforme. Elle possède la philosophie de la cytométrie conventionnelle car il est nécessaire d'acquérir des lames de tissus monomarqués afin de produire une matrice de compensation. Ensuite, le système permet d'analyser une lame multimarquée (20 canaux) avec un débit plus important que l'Hyperion.
Savoir faire
Le personnel de la plateforme possède les compétences scientifiques et techniques pour la mise en œuvre de projet depuis la préparation des échantillons jusqu'à l'analyse des données et assure les prestations et les formations nécessaires.
La plate-forme accepte tous les systèmes biologiques de classe 1 ou 2.
Ses ressources permettent de caractériser et séparer des populations de cellules, procaryotes comme eucaryotes, ou de particules (vésicules, nanoparticules, organites ...) pour la recherche fondamentale et/ou clinique.
Applications
- Immunophénotypage d’échantillons biologiques (40 fluorochromes et 50 métaux).
- Détection de molécules membranaires, intracellulaires (cytokines, phospho-protéines) et intranucléaires.
- Etude de l'apoptose, du cycle cellulaire, de la prolifération cellulaire.
- Dosage multiplex de cytokines, phospho-protéines.
- Tri de cellules animales ou végétales, de levures, de bactéries et de nanoparticules
- Analyse de coupes de tissus (inclus en paraffine ou congelés) ou de cellules fixées sur lames de verre, analyse du microenvironnement tumoral (jusque 45 marqueurs)
- Clonage (tri 1 cellule/puit)
Equipements
- Cytomètre de masse Helios (Standard BioTools) – 50 paramètres
- Cytomètre spectral Aurora (CYTEK) - 5 lasers - 40+ paramètres
- Cytomètre analyseur Cytoflex S (Beckman Coulter) – 4 lasers – 15 paramètres
- Cytomètre trieur Cytoflex SRT (Beckman Coulter) - 4 lasers - 17 paramètres
- Imagerie de masse Hyperion (Standard BioTools) – 45 paramètres
- Imagerie multiplexée Orion (Rarecyte) - 9 lasers - 17 paramètres
Equipe
Accès
La plateforme réalise des prestations de service pour la communauté scientifique et pour les industriels. Certains systèmes sont accessibles aux utilisateurs souhaitant être autonomes après formation par le personnel de la plateforme. L'accès à la plateforme est soumis à tarification.